RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 LTBP1Q14766 1721 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 SCN9AQ15858 1988 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-204ENST00000558666 UBN2Q6ZU65 1347 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ATP10DQ9P241 1426 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFB5O43674 189 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ADGRE1Q14246 886 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CEP135Q66GS9 1140 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PRR5LQ6MZQ0 368 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 OLFM4Q6UX06 510 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 FBXO11Q86XK2 927 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TSPYL6Q8N831 410 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ECM29Q5VYK3 1845 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 COL4A5P29400 1685 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 A0A087WZG4 1122 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf172C9J069 976 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DLL1O00548 723 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 EREGO14944 169 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 GATA4P43694 442 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ST5P78524 1137 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SETDB2Q96T68 719 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 FAM129BQ96TA1 746 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.51□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 NFKBIEO00221 500 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 EDN3P14138 238 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PTPRAP18433 802 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 EPHA1P21709 976 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 GNAI1P63096 354 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SETDB1Q15047 1291 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 COPS6Q7L5N1 327 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SYNE4Q8N205 404 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PMEPA1Q969W9 287 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 HHIPQ96QV1 700 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 MUC3BQ9H195 1237 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PPME1Q9Y570 386 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SCN4AP35499 1836 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CHL1O00533 1208 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 IGHA2P01877 340 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CDC27P30260 824 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TM4SF1P30408 202 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 G2E3Q7L622 706 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 MYD88Q99836 296 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 IFT57Q9NWB7 429 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 RNF181Q9P0P0 153 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ADCY9O60503 1353 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 H0YIN7 160 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 GPR182O15218 404 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ADAM23O75077 832 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 NTSR2O95665 410 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 KCNA3P22001 575 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SUSD4Q5VX71 490 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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