RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-210ENST00000485459 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-210ENST00000485459 TM9SF2Q99805 663 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-210ENST00000485459 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-210ENST00000485459 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-210ENST00000485459 UNCXA6NJT0 531 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 MEIS1O00470 390 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 GPRASP2Q96D09 838 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 TCTN2Q96GX1 697 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA32Q96LK8 384 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC38A3Q99624 504 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 HDAC8Q9BY41 377 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 TCFL5Q9UL49 500 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 FITM1A5D6W6 292 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SIGLEC6O43699 453 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 FKTNO75072 461 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF1O95521 474 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 HPXP02790 462 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 TEKQ02763 1124 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 CHST7Q9NS84 486 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 GINM1Q9NU53 330 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 C8AP07357 584 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SYPP08247 313 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 ACRP10323 421 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 DIRC2Q96SL1 478 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 DSCC1Q9BVC3 393 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 GFOD1Q9NXC2 390 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 GUCY2CP25092 1073 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRNEQ04844 493 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR160Q9UJ42 338 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 LILRA2Q8N149 483 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM84AQ96KN4 292 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF32Q9H0A6 362 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 C9IYK1 514 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC14A2Q15849 920 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF124Q15973 351 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 BBS9Q3SYG4 887 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-210ENST00000485459 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 SOX9P48436 509 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 DCAF15Q66K64 600 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 GJA8P48165 433 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 NR0B2Q15466 257 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP2R5EQ16537 467 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 LCE3BQ5TA77 95 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-210ENST00000485459 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms