RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 CCDC51Q96ER9 411 aa21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 NELFBQ8WX92 580 aa21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 AK7Q96M32 723 aa21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 CHP1Q99653 195 aa21.25■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 MCM7P33993 719 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 PPP2R5BQ15173 497 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 L1RE1Q9UN81 338 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 KCNJ18B7U540 433 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 AMPD2Q01433 879 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 PAK1Q13153 545 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 KCNJ12Q14500 433 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 BTG4Q9NY30 223 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 TFR2Q9UP52 801 aa21.24■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 BMP15O95972 392 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 LMAN1P49257 510 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 IQUBQ8NA54 791 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 TAF1P21675 1872 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.23■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 KRT9P35527 623 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 ZSCAN26Q16670 478 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 CTR9Q6PD62 1173 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 EXOC4Q96A65 974 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 VPS18Q9P253 973 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 PRCPP42785 496 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 HDXQ7Z353 690 aa21.22■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 NTSR2O95665 410 aa21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 A0A1B0GUL6 1792 aa21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 GPS2Q13227 327 aa21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 IQCA1Q86XH1 822 aa21.21■□□□□ 0.99
CITED2-201ENST00000367651 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 POTEB2H3BUK9 544 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CAMTA2O94983 1202 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CTAGE8P0CG41 777 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.2■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 USP17L12C9JPN9 530 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 USP17L21D6R901 530 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 DDAH1O94760 285 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 FGRP09769 529 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 NLRP5P59047 1200 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 UBXN1Q04323 297 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 TTC26A0AVF1 554 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 SCG2P13521 617 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 TUBB2AQ13885 445 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 MYO6Q9UM54 1294 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 ENC1O14682 589 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CYP2D6P10635 497 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CASP8Q14790 479 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 PP2D1A8MPX8 630 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 NDUFA10O95299 355 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CALM1P0DP23 149 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CALM2P0DP24 149 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 CALM3P0DP25 149 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 ERLIN1O75477 346 aa21.17■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CITED2-201ENST00000367651 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.4 ms