RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 STIM1Q13586 685 aa25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 COG1Q8WTW3 980 aa25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 JRKLQ9Y4A0 524 aa25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 E2F4Q16254 413 aa25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 RABEP2Q9H5N1 569 aa25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP3K12Q12852 859 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 FERMT2Q96AC1 680 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGPSO00116 658 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTSWP56202 376 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTR9Q6PD62 1173 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR59Q6PJI9 974 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH6P13533 1939 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL18A1P39060 1754 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 RCCD1A6NED2 376 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRCPP42785 496 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPM1EQ8WY54 764 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 EHD4Q9H223 541 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNKSO95271 1327 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL17AQ16552 155 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC38Q5R3I4 469 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM14Q14142 442 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPAG1Q07617 926 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 NLRP10Q86W26 655 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMTC2Q8N394 836 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAMTS3O15072 1205 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP9Q49MG5 647 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 XBP1P17861 261 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 FUT2Q10981 343 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPY5RQ15761 445 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 KAT14Q9H8E8 782 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEC23AQ15436 765 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 MB21D1Q8N884 522 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRC1Q96MC2 740 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 C2orf54Q08AI8 447 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAGE1Q8TC20 777 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 LPIN2Q92539 896 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCM7P33993 719 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPARAQ07869 468 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1328Q86T90 577 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALS2Q96Q42 1657 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNFRSF25Q93038 417 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC7Q99615 494 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCT5P48643 541 aa25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGFR2P21802 821 aa25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms