RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.16■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.15■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 YY1AP1Q9H869 796 aa23.15■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.15■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 N4BP3O15049 544 aa23.15■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 LIFRP42702 1097 aa23.15■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 CHD4Q14839 1912 aa23.14■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.14■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 GUCY2CP25092 1073 aa23.14■■□□□ 1.3
PMS1-222ENST00000639501 TUBBP07437 444 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 KRT9P35527 623 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 GGCXP38435 758 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 WASF1Q92558 559 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 PHLPP1O60346 1717 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 ABCC12Q96J65 1359 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 AGPSO00116 658 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 SEMA3EO15041 775 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 RTN1Q16799 776 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 COG1Q8WTW3 980 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 EHD4Q9H223 541 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CPP00450 1065 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 PDE6AP16499 860 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 NDUFA10O95299 355 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 STIM1Q13586 685 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 FAM89AQ96GI7 184 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 HINFPQ9BQA5 517 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 XDHP47989 1333 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 NID2Q14112 1375 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 HERVK_113P62684 666 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 SYNE4Q8N205 404 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 KAT2BQ92831 832 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 GSDMAQ96QA5 445 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 KAT14Q9H8E8 782 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 PSMD14O00487 310 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 METTL24Q5JXM2 366 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 EXOC5O00471 708 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 DEXIO95424 95 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 UBE3CQ15386 1083 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 E2F4Q16254 413 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.1■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.295e-7■■■□□ 14.9
PMS1-222ENST00000639501 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.09■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.09■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 CCT5P48643 541 aa23.09■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 AIDAQ96BJ3 306 aa23.09■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.09■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 MYH6P13533 1939 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 TRIM75PA6NK02 468 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 ZNF185O15231 689 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-222ENST00000639501 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 TTC26A0AVF1 554 aa23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 PHKA1P46020 1223 aa23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 MTRQ99707 1265 aa23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.08■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 KCNJ18B7U540 433 aa23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 LIG3P49916 1009 aa23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 KCNJ12Q14500 433 aa23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 MAP9Q49MG5 647 aa23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 NAPBQ9H115 298 aa23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PMS1-222ENST00000639501 PRDM1O75626 825 aa23.07■■□□□ 1.28
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