RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 FECHP22830 423 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 LPIN2Q92539 896 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CCDC102AQ96A19 550 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 AMPD2Q01433 879 aa28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 RRAGBQ5VZM2 374 aa28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 SRLQ86TD4 932 aa28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 ENC1O14682 589 aa28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 GSDMAQ96QA5 445 aa28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 TNKSO95271 1327 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 ADAMTS3O15072 1205 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 ERLIN1O75477 346 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 POTEB2H3BUK9 544 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 BCAMP50895 628 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 ADGRA1Q86SQ6 560 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 TMTC1Q8IUR5 882 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 GUCA1BQ9UMX6 200 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 KRT2P35908 639 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 COPB1P53618 953 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 SEC23AQ15436 765 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 MYO6Q9UM54 1294 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 ITIH6Q6UXX5 1313 aa28.59■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 IL2RBP14784 551 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 KRT9P35527 623 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PPARAQ07869 468 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 FUT2Q10981 343 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PIGBQ92521 554 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 RASSF4Q9H2L5 321 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.58■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 SRGAP2O75044 1071 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 PTGDRQ13258 359 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 NPY5RQ15761 445 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 IQUBQ8NA54 791 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TSPYL1Q9H0U9 437 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 RSPH14Q9UHP6 348 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 SEMA3EO15041 775 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 E2F4Q16254 413 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 IL17AQ16552 155 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 CCDC51Q96ER9 411 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 GDAQ9Y2T3 454 aa28.57■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD65E5RJM6 399 aa28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 CYP26C1Q6V0L0 522 aa28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 LEKR1Q6ZMV7 388 aa28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 PDE8AO60658 829 aa28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 KCNJ18B7U540 433 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 KCNJ12Q14500 433 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 NELFBQ8WX92 580 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 LRRC10BA6NIK2 292 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 ZMYND10O75800 440 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TTC38Q5R3I4 469 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TNFRSF25Q93038 417 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.55■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 PIP4K2BP78356 416 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TUBB2AQ13885 445 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 MMS19Q96T76 1030 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TUBB2BQ9BVA1 445 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 SLC5A1P13866 664 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 EVX2Q03828 476 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 TMTC2Q8N394 836 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 MYH6P13533 1939 aa28.54■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 UBXN1Q04323 297 aa28.53■■■□□ 2.16
SENP3-201ENST00000321337 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms