RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 PANX2Q96RD6 677 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHP1Q99653 195 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAPBQ9H115 298 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ITGA6P23229 1130 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIP4K2BP78356 416 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC20A2Q08357 652 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 RTN1Q16799 776 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF174Q15697 407 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP112Q8N8E3 955 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAGE5Q96GU1 130 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 DACH1Q9UI36 760 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTAGE8P0CG41 777 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CUL4BQ13620 913 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA1Q5VX52 437 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 N4BP3O15049 544 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGAP25P42331 645 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIGBQ92521 554 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM87BQ96K49 555 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFNAR1P17181 557 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 HLFQ16534 295 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB21Q9UL25 225 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 PBX1P40424 430 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT31Q15323 416 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYO1BO43795 1136 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCIRG1Q13488 830 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC31Q6UY01 552 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TJP1Q07157 1748 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERLIN1O75477 346 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TDO2P48775 406 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 WTAPQ15007 396 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTS3O15072 1205 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 LCORLQ8N3X6 602 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYH8P13535 1937 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP5P45974 858 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 PACS2Q86VP3 889 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT9P35527 623 aa24■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMS19Q96T76 1030 aa24■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA20Q8TB22 786 aa24■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSD3Q9NYI0 1048 aa24■■□□□ 1.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYO6Q9UM54 1294 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms