RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa7,97□□□□□ -1,13
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2dO70555 85 aa7,83□□□□□ -1,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A1Y7VJH8 109 aa7,82□□□□□ -1,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1eQ9D139 143 aa7,79□□□□□ -1,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1kJ3QP15 125 aa7,75□□□□□ -1,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2iO70560 76 aa7,69□□□□□ -1,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1cQ9D1C5 147 aa7,69□□□□□ -1,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa7,67□□□□□ -1,18
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP7,1□□□□□ -1,27
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Mt3P28184 68 aa6,66□□□□□ -1,34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm9112A2AI92 75 aa6,66□□□□□ -1,34
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa6,35□□□□□ -1,39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2eO70556 76 aa6,31□□□□□ -1,4
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa5,93□□□□□ -1,46
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Odc1-201ENSMUST00000171737 1110025L11RikO09048 78 aa5,53□□□□□ -1,52
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Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A1Y7VJ07 166 aa5,43□□□□□ -1,54
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2bO70554 98 aa4,64□□□□□ -1,67
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Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A286YCP9 139 aa4,24□□□□□ -1,73
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa3,85□□□□□ -1,79
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa3,46□□□□□ -1,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa3,42□□□□□ -1,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap5-1Q64507 230 aa3,38□□□□□ -1,87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm4559A4IF42 199 aa2,89□□□□□ -1,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa2,77□□□□□ -1,97
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