RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 ADORA1P30542 326 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 POLA2Q14181 598 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GPT2Q8TD30 523 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ADCY9O60503 1353 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 HSF2BPO75031 334 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 FAM13AO94988 1023 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CYP21A2P08686 494 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 MADDQ8WXG6 1647 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PHKA1P46020 1223 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SIK1P57059 783 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CUL4AQ13619 759 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 UBE3CQ15386 1083 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 FERMT2Q96AC1 680 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 A6NNZ2 444 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PDE4DQ08499 809 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SEPT6Q14141 434 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 VPS16Q9H269 839 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 JDP2Q8WYK2 163 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 MAST3O60307 1309 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 NR1I2O75469 434 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 POSTNQ15063 836 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGAP25P42331 645 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TXKP42681 527 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ALKQ9UM73 1620 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 FANCBQ8NB91 859 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TRAF5O00463 557 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ATP2C2O75185 946 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SASH1O94885 1247 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CHRNDQ07001 517 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SCRN1Q12765 414 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TSC1Q92574 1164 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 USP21Q9UK80 565 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CTNNA2P26232 953 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ELF2Q15723 593 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ZMYM6O95789 1325 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PHACTR2O75167 634 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PSMD1Q99460 953 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PFKFB1P16118 471 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ATG3Q9NT62 314 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 TNKSO95271 1327 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PAK1Q13153 545 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PLVAPQ9BX97 442 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms