RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407643.5

TTYH3-204, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTYH3, Length 4,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-204ENST00000407643 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.91□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.91□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 GBP3Q9H0R5 595 aa14.91□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.91□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 ERLIN2O94905 339 aa14.91□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 SPAG1Q07617 926 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 ADALQ6DHV7 355 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 MYO6Q9UM54 1294 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 CHRNDQ07001 517 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 TCP10Q12799 353 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 KRT79Q5XKE5 535 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 IL25Q9H293 177 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 CUTAO60888 179 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 NEFHP12036 1026 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 ELF2Q15723 593 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 KRT222Q8N1A0 295 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 GOPCQ9HD26 462 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 TNKSO95271 1327 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 ERBB4Q15303 1308 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.9□□□□□ -0.02
TTYH3-204ENST00000407643 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 NLRP12P59046 1061 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 PPARDQ03181 441 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 POSTNQ15063 836 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 HLFQ16534 295 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 PIGBQ92521 554 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CTAGE8P0CG41 777 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CARD6Q9BX69 1037 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 FAM107BQ9H098 131 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 VPS36Q86VN1 386 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 DESI2Q9BSY9 194 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 SIK1P57059 783 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 DYMQ7RTS9 669 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CCDC42Q96M95 316 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 ADGRB3O60242 1522 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 TNIP1Q15025 636 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 FANCBQ8NB91 859 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 PDE4DQ08499 809 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.88□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 EVCP57679 992 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 FANCLQ9NW38 375 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CTAGE9A4FU28 777 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 KIAA0754O94854 1291 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 GNA11P29992 359 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 SP4Q02446 784 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 PSMB7Q99436 277 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 APOA5Q6Q788 366 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 JDP2Q8WYK2 163 aa14.87□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 KIF20AO95235 890 aa14.86□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 NR5A1Q13285 461 aa14.86□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 MAP9Q49MG5 647 aa14.86□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.86□□□□□ -0.03
TTYH3-204ENST00000407643 CTR9Q6PD62 1173 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms