RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 OGFRQ9NZT2 677 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PDE8AO60658 829 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 BIRC3Q13489 604 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CCT6BQ92526 530 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 POLKQ9UBT6 870 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PICALMQ13492 652 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 HAUS1Q96CS2 278 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CRCPO75575 148 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 HOXC9P31274 260 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RASSF2P50749 326 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TBX22Q9Y458 520 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PAK1Q13153 545 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 AZI2Q9H6S1 392 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GGA1Q9UJY5 639 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SPOPO43791 374 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 DNM2P50570 870 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 KDRP35968 1356 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TNNI3KQ59H18 835 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 APPBP2Q92624 585 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 USP26Q9BXU7 913 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RAB17Q9H0T7 212 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MYOM2P54296 1465 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 VAMP4O75379 141 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TFCP2Q12800 502 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 M0QZ92 97 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SLC1A4P43007 532 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PSMC4P43686 418 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf34Q49A92 452 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CEP170Q5SW79 1584 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GUA9 196 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 IGHDP01880 384 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TSPOAP1O95153 1857 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PFDN6O15212 129 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LAD1O00515 517 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF790Q6PG37 636 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF365Q70YC5 407 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TEX11Q8IYF3 940 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GNPATO15228 680 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 UFL1O94874 794 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MBD4O95243 580 aa6.69□□□□□ -1.34
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