RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WT1-ASQ06250 92 aa-1.62□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCOA2Q15596 1464 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R143 59 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C14orf144Q96I85 54 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-1.63□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.64□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.64□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1LQ93083 61 aa-1.64□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.65□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.66□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.66□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.66□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.66□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-1.67□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITSN1Q15811 1721 aa-1.67□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.67□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-1.67□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.67□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-1.68□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBL5Q9BZL1 73 aa-1.68□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-1.68□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NREPQ16612 68 aa-1.69□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.7□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WXM4 84 aa-1.72□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q9H521 79 aa-1.72□□□□□ -2.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.72□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.73□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.73□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.73□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.73□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-1.74□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.74□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.74□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01546A6NGU7 62 aa-1.75□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A8P05109 93 aa-1.75□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKIAP61925 76 aa-1.75□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF1AQ12756 1690 aa-1.75□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS8Q8N3P4 1428 aa-1.75□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSMD2Q7Z408 3487 aa-1.75□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.76□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-1.76□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LY75O60449 1722 aa-1.76□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.76□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH5Q8TE73 4624 aa-1.76□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.76□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCC3O15438 1527 aa-1.76□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0QZ58 72 aa-1.77□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1MQ8N339 61 aa-1.77□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf48Q9UBA6 75 aa-1.77□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT2AP02795 61 aa-1.78□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.78□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 V9GYS6 101 aa-1.78□□□□□ -2.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRAPQ86VF7 1730 aa-1.79□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-1.79□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-1.79□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0QY20 66 aa-1.79□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-1.79□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF14Q15058 1648 aa-1.8□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FCER1GP30273 86 aa-1.8□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRIP1P50238 77 aa-1.8□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.81□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATMQ13315 3056 aa-1.81□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A8MTW9 85 aa-1.81□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.81□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM5DQ9BY66 1539 aa-1.81□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKAP12Q02952 1782 aa-1.82□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-1.82□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.82□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1GP13640 62 aa-1.82□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.83□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TJP1Q07157 1748 aa-1.83□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RICTORQ6R327 1708 aa-1.83□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.84□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB121Q5J5C9 76 aa-1.84□□□□□ -2.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1BP07438 61 aa-1.85□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.85□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPLO60437 1756 aa-1.85□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTC37Q6PGP7 1564 aa-1.87□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFTA3P0C7M3 94 aa-1.88□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADIRFQ15847 76 aa-1.88□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB114Q30KQ6 69 aa-1.88□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.89□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCC1P33527 1531 aa-1.91□□□□□ -2.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST20Q9HBF5 79 aa-1.91□□□□□ -2.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABRACLQ9P1F3 81 aa-1.91□□□□□ -2.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NHSQ6T4R5 1651 aa-1.91□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.2 ms