RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.96□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.96□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 M0R129 80 aa-0.97□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.97□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 RPRMQ9NS64 109 aa-0.97□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 Q9Y3F1 56 aa-0.97□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.97□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 NDUFA4O00483 81 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 NBEAP1P0C6P0 100 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 TAC4Q86UU9 113 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 TSLPQ969D9 159 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 AMELXQ99217 191 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.98□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 BCE1O60756 84 aa-0.99□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.99□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 A6NIN4 97 aa-1□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 TPPP2P59282 170 aa-1□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 DEFB131AP59861 70 aa-1□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 PP6455Q8WZ26 134 aa-1□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 SPRR4Q96PI1 79 aa-1□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 I3L2K1 104 aa-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 DBIP07108 87 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 NCS1P62166 190 aa-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 UBE2G1P62253 170 aa-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 CCDC153Q494R4 210 aa-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 MMGT1Q8N4V1 131 aa-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 SMIM4Q8WVI0 70 aa-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-1.01□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 PIGYQ3MUY2 71 aa-1.02□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 MORN2Q502X0 79 aa-1.02□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 SCIMPQ6UWF3 145 aa-1.02□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-1.03□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-1.03□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 S100A5P33763 92 aa-1.03□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.03□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-1.03□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 NPVFQ9HCQ7 196 aa-1.03□□□□□ -2.57
CMC1-211ENST00000495428 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 IGLC6P0CF74 106 aa-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 Q0VG73 95 aa-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 R4GMQ9 66 aa-1.04□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 FGF7P21781 194 aa-1.05□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 FAM223AQ8IWN6 122 aa-1.05□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-1.05□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 AIF1LQ9BQI0 150 aa-1.05□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 TMEM262E9PQX1 116 aa-1.06□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 GYPAP02724 150 aa-1.06□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-1.06□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 MAFIPQ8WZ33 124 aa-1.06□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-1.06□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 FAM24AA6NFZ4 105 aa-1.07□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 M0R1W7 72 aa-1.07□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 NDUFC1O43677 76 aa-1.07□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 NCR2O95944 276 aa-1.07□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 Q6ZUT4 128 aa-1.07□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 HCG22E2RYF7 251 aa-1.08□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 LINC00694P0DN24 101 aa-1.08□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 COX17Q14061 63 aa-1.08□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 PSMG4Q5JS54 123 aa-1.08□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 AKAP14Q86UN6 197 aa-1.08□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 M0R135 149 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 NDUFB6O95139 128 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 IL5P05113 134 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 TSPAN19P0C672 248 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 WT1-ASQ06250 92 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 S100A7L2Q5SY68 101 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.09□□□□□ -2.58
CMC1-211ENST00000495428 M0R2Z0 102 aa-1.1□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 SIX6O95475 246 aa-1.1□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.1□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 SPTSSAQ969W0 71 aa-1.1□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 H7BZZ5 65 aa-1.11□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 PPP1R17O96001 155 aa-1.11□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.11□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 M0QY20 66 aa-1.12□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 C3orf79P0CE67 100 aa-1.12□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.12□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 SMIM3Q9BZL3 60 aa-1.12□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-1.13□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-1.13□□□□□ -2.59
CMC1-211ENST00000495428 J3QR89 54 aa-1.13□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms