RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 ERC2-IT1O76042 136 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 CCKP06307 115 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N377 158 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GV72 72 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGMAR1Q99720 223 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-1P60331 282 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 CDIP1Q9H305 208 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf137Q5JT78 98 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZSA8 131 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 F8WEM9 126 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZQT0 140 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF861PO60384 105 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAH2Q9P225 4427 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 SCXQ7RTU7 201 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR1BP22528 89 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00643Q86TS7 51 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GW54 56 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV7-43P04211 117 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM29Q86T20 159 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 UBL5Q9BZL1 73 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00846Q9NV44 126 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 XGP55808 180 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6JHZ5 121 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GVY2 172 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 MT-ATP8P03928 68 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR4Q96PI1 79 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00483Q53H64 154 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 IMUPQ9GZP8 106 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8NBF4 154 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PNM2 257 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 HAMPP81172 84 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 NREPQ16612 68 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 SCGB1A1P11684 91 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYGAP11844 174 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6Q795 121 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFL1Q6UW32 110 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZVQ6 151 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.09□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.09□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCL6P80162 114 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JQZ4 141 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WSZ3 146 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 BPY2O14599 106 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 MOBPQ13875 183 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-201ENST00000319942 PCP4P48539 62 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 PKD1P98161 4303 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 SS18L2Q9UHA2 77 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 CD164Q04900 197 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK2AP2O75956 126 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-201ENST00000319942 J3KT08 172 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WVE0 104 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087X002 238 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 RYR2Q92736 4967 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms