RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641357.1

CASC19-223, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,069 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-223	ENST00000641357		Q8N814	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-223	ENST00000641357	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-223	ENST00000641357	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-223	ENST00000641357	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	PCP4	P48539	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357		Q9HAA7	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357		Q6Q795	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357		Q6ZRP5	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	XG	P55808	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	COX7B	P24311	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-223	ENST00000641357	PRY	O14603	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	PDE6G	P18545	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	MT3	P25713	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	CCK	P06307	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	SPRR1A	P35321	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357		Q6ZQY7	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	PSCA	O43653	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357		Q6JHZ5	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357		Q6ZQT0	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357		Q6ZRX8	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-223	ENST00000641357		A0A1B0GV72	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357		A0A096LNI7	61 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357		A0A1B0GW54	56 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357		Q6ZR54	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357		H0Y9J4	135 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-223	ENST00000641357		Q9BRP9	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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