RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 HBDP02042 147 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFA6P56556 154 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 C2orf82Q6UX34 121 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8IZM0 81 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BRM9 83 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 PMAIP1Q13794 54 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 LUZP6Q538Z0 58 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 SIGMAR1Q99720 223 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A096LNJ9 63 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 BAGE3Q86Y29 109 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 COX7B2Q8TF08 81 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 COLCA2A8K830 154 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 F8VRH5 84 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 TRGC2P03986 189 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLC3P0DOY3 106 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 PMCHL1Q16048 86 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 SPINK8P0C7L1 97 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GV72 72 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 C11orf86A6NJI1 115 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF861PO60384 105 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 LEPROTL1O95214 131 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf137Q5JT78 98 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 C22orf24Q9Y442 160 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 MYCBP2O75592 4640 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 NUPR1O60356 82 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2BP63146 152 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-216ENST00000590105 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV7-43P04211 117 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 COX17Q14061 63 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 SFTA2Q6UW10 78 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01600Q96MT4 127 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 FABP4P15090 132 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 Q5W150 140 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00587B1AMM8 73 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00313P59037 77 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-8P60410 259 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00167Q96N53 147 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 ERG28Q9UKR5 140 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 K7ERS5 55 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1HL1P0DM35 61 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00158P58513 81 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 DIRC1Q969H9 104 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BKO60814 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BJP06899 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BOP23527 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BBP33778 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BDP58876 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BCP62807 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 LEPROTO15243 131 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 DPM2O94777 84 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKCP01834 107 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 PLNP26678 52 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM13P0DJ93 91 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 S100A1P23297 94 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 S100A2P29034 98 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 S100A12P80511 92 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 HERC1Q15751 4861 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 BCE1O60756 84 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 DSCR10P59022 87 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 J3QQQ9 107 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 M0R378 163 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms