RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 LCE6AA0A183 80 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GX51 115 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 K7ERU9 68 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 hADV29S1A0JD25 119 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNCGO76070 127 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.29□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.29□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 PANO1I0J062 215 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRYO14603 147 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPH3Q96FX2 82 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 J3QR89 54 aa11.25□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZQY7 126 aa11.23□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.23□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPRR1AP35321 89 aa11.23□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.22□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 REG3GQ6UW15 175 aa11.21□□□□□ -0.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 B5MCH6 92 aa11.21□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPM2AB3EWF7 344 aa11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRTAP10-2P60368 255 aa11.2□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GV72 72 aa11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE2BP63146 152 aa11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZRX8 168 aa11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.19□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.16□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS25Q9BRG1 176 aa11.16□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q9BRP9 147 aa11.16□□□□□ -0.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.14□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.14□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.14□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.13□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.13□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.13□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.12□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 PKD1P98161 4303 aa11.12□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 RYR2Q92736 4967 aa11.12□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.12□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.11□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 H3BQ85 93 aa11.1□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERC2-IT1O76042 136 aa11.1□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRLHP81277 87 aa11.1□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.09□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 GHRHP01286 108 aa11.09□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.09□□□□□ -0.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.08□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDIP1Q9H305 208 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZSA8 131 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRTAP10-1P60331 282 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q8N377 158 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE2AP49459 152 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCE1O60756 84 aa11.02□□□□□ -0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GVY2 172 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 H0Y9J4 135 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 C3orf22Q8N5N4 141 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.99□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCKP06307 115 aa10.99□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACYP1P07311 99 aa10.98□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 DSCR8Q96T75 97 aa10.98□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.98□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZQT0 140 aa10.97□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCXQ7RTU7 201 aa10.97□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.96□□□□□ -0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.95□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 XGP55808 180 aa10.95□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAMPP81172 84 aa10.95□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1orf137Q5JT78 98 aa10.94□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIGMAR1Q99720 223 aa10.94□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.93□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 MT-ATP8P03928 68 aa10.92□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMIM29Q86T20 159 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms