RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492354.1

SZRD1-210, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-210ENST00000492354 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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SZRD1-210ENST00000492354 C15orf56Q8N910 161 aa6.27□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.27□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 M0R378 163 aa6.26□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.26□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.26□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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SZRD1-210ENST00000492354 J3KT08 172 aa6.25□□□□□ -1.41
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SZRD1-210ENST00000492354 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.25□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.25□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.25□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 SYCNQ0VAF6 134 aa6.25□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 SNURFQ9Y675 71 aa6.25□□□□□ -1.41
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SZRD1-210ENST00000492354 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.24□□□□□ -1.41
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SZRD1-210ENST00000492354 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.22□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 DPH3Q96FX2 82 aa6.22□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.22□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.22□□□□□ -1.41
SZRD1-210ENST00000492354 FAM168BA1KXE4 195 aa6.21□□□□□ -1.41
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SZRD1-210ENST00000492354 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.21□□□□□ -1.42
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SZRD1-210ENST00000492354 H3BNG1 76 aa6.19□□□□□ -1.42
SZRD1-210ENST00000492354 RMI2Q96E14 147 aa6.19□□□□□ -1.42
SZRD1-210ENST00000492354 H3BQ85 93 aa6.19□□□□□ -1.42
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SZRD1-210ENST00000492354 IGKV4-1P06312 121 aa6.11□□□□□ -1.43
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SZRD1-210ENST00000492354 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.07□□□□□ -1.44
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SZRD1-210ENST00000492354 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 REG3GQ6UW15 175 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 Q5XG85 94 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 DNAH2Q9P225 4427 aa6.04□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.04□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 Q8NBF4 154 aa6.04□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 A0A096LNI7 61 aa6.03□□□□□ -1.44
SZRD1-210ENST00000492354 OCR1Q9BZK8 76 aa6.03□□□□□ -1.44
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