RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 A0A096LNI7 61 aa14.88□□□□□ -0.03
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FAAP20-209ENST00000428120 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.84□□□□□ -0.03
FAAP20-209ENST00000428120 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.84□□□□□ -0.03
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FAAP20-209ENST00000428120 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.66□□□□□ -0.06
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FAAP20-209ENST00000428120 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.64□□□□□ -0.07
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FAAP20-209ENST00000428120 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.58□□□□□ -0.08
FAAP20-209ENST00000428120 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.57□□□□□ -0.08
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FAAP20-209ENST00000428120 RTL8CO15255 209 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-209ENST00000428120 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.52□□□□□ -0.09
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FAAP20-209ENST00000428120 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.47□□□□□ -0.09
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FAAP20-209ENST00000428120 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.46□□□□□ -0.1
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FAAP20-209ENST00000428120 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM29Q86T20 159 aa14.4□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 HAMPP81172 84 aa14.39□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 DNAH8Q96JB1 4490 aa14.39□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 C3orf84H3BNL1 204 aa14.38□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf137Q5JT78 98 aa14.37□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.36□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa14.36□□□□□ -0.11
FAAP20-209ENST00000428120 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.36□□□□□ -0.11
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