RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 C22orf24Q9Y442 160 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 PSCAO43653 123 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.59□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R378 163 aa2.59□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N814 137 aa2.59□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.59□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.59□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 NUPR2A6NF83 97 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 SNCGO76070 127 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE2BQ13066 116 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GX51 115 aa2.59□□□□□ -2
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LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf195Q5TG92 126 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00575Q6W349 94 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 DIRC1Q969H9 104 aa2.59□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 hADV29S1A0JD25 119 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0A0MQY5 61 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 MT-ATP8P03928 68 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.58□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM168BA1KXE4 195 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 COX7BP24311 80 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R2N4 97 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP10-2P60368 255 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00167Q96N53 147 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZQY7 126 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 C7orf33Q8WU49 177 aa2.57□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC32Q5I0X7 151 aa2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.56□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 ACYP1P07311 99 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf177Q52M58 125 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A096LNI7 61 aa2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 BRK1Q8WUW1 75 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PNN7 141 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf90A8MZG2 172 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 CHTF8P0CG12 524 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.54□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 PRYO14603 147 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 CCKP06307 115 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 SCGB1A1P11684 91 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00846Q9NV44 126 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 FBN3Q75N90 2809 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 TGP01266 2768 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 DPH3Q96FX2 82 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.53□□□□□ -2
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BQ85 93 aa2.53□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZRX8 168 aa2.53□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00643Q86TS7 51 aa2.53□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 DSCR8Q96T75 97 aa2.53□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 LY6G6CO95867 125 aa2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 SPRR1AP35321 89 aa2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2BP63146 152 aa2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 REG3GQ6UW15 175 aa2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 Q9BRP9 147 aa2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 KMT2AQ03164 3969 aa2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.52□□□□□ -2.01
LRRTM4-201ENST00000409088 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.52□□□□□ -2.01
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