RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235349.5

PRAMEF4-201, Transcript of PRAME family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF4, Length 1,828 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4-201ENST00000235349 COX17Q14061 63 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAMEF4-201ENST00000235349 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q8IZM0 81 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAMEF4-201ENST00000235349 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAMEF4-201ENST00000235349 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAMEF4-201ENST00000235349 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.71□□□□□ -1.33
PRAMEF4-201ENST00000235349 A0A087WVE0 104 aa6.71□□□□□ -1.33
PRAMEF4-201ENST00000235349 NCR3O14931 201 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C6orf223Q8N319 242 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 UBL5Q9BZL1 73 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 M0R2N4 97 aa6.7□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q8N814 137 aa6.7□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 KLKP1Q107X0 134 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 H7BZZ5 65 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 NDUFC1O43677 76 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRAMEF4-201ENST00000235349 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C15orf56Q8N910 161 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C10orf25Q5T742 122 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C3orf84H3BNL1 204 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRAMEF4-201ENST00000235349 SPAG11BQ08648 103 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C20orf197Q8N268 126 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 RMI2Q96E14 147 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 SLPIP03973 132 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAMEF4-201ENST00000235349 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q6ZR54 194 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 CXCL6P80162 114 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 LINC00575Q6W349 94 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q6ZQT0 140 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 PSCAO43653 123 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q6ZRU5 148 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 ERC2-IT1O76042 136 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.61□□□□□ -1.35
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PRAMEF4-201ENST00000235349 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.59□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 SYCNQ0VAF6 134 aa6.59□□□□□ -1.35
PRAMEF4-201ENST00000235349 V9GYY9 64 aa6.59□□□□□ -1.35
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PRAMEF4-201ENST00000235349 C6orf99Q4VX62 202 aa6.58□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 SEC61GP60059 68 aa6.57□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 C1orf195Q5TG92 126 aa6.57□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.57□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.56□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.56□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q6ZVQ6 151 aa6.56□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 F8WEM9 126 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 IGLV6-57P01721 117 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q8NDZ9 215 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q6ZRP5 223 aa6.54□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 A0A087WTM6 91 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 HAMPP81172 84 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 PKD1P98161 4303 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAMEF4-201ENST00000235349 RTL8CO15255 209 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 C14orf177Q52M58 125 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 DIRC1Q969H9 104 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 TNP2Q05952 138 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 SNURFQ9Y675 71 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 LCE6AA0A183 80 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 Q6ZQY7 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 RYR2Q92736 4967 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 BRK1Q8WUW1 75 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 COX7BP24311 80 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 A0A1B0GW54 56 aa6.48□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 FAM168BA1KXE4 195 aa6.48□□□□□ -1.37
PRAMEF4-201ENST00000235349 PRR15Q8IV56 129 aa6.48□□□□□ -1.37
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