RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CLPSL2Q6UWE3 100 aa17.19■□□□□ 0.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIGD2BQ4VC39 106 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00643Q86TS7 51 aa16.7■□□□□ 0.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZRU5 148 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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