RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 PTTG1IPP53801 180 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 LINC00587B1AMM8 73 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 Q6ZRP5 223 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 HERVK_113P61574 105 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 GAGE2BQ13066 116 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 SFTA2Q6UW10 78 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 LEPROTO15243 131 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 A0A087WYN8 130 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 E9PLD3 99 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 DPH3Q96FX2 82 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 J3QQQ9 107 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 STPG4Q8N801 248 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 COX8AP10176 69 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 GAGE2EQ4V326 116 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 HERV-K104P63124 156 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 COX17Q14061 63 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 C14orf144Q96I85 54 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 ERG28Q9UKR5 140 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PNN7 141 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 DLEU1O43261 78 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 NMUP48645 174 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 PFN2P35080 140 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-231ENST00000552222 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 FAM168BA1KXE4 195 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 LINC00158P58513 81 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 SMIM13P0DJ93 91 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 A0A0U1RRA0 63 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 CTAG1AP78358 180 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 A0A0J9YXY3 114 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 M0R143 59 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 PCP2Q8IVA1 136 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-231ENST00000552222 ZNF815PA8K554 130 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 C7orf33Q8WU49 177 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 HIGD1BQ9P298 99 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 M0QXV9 152 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 C22orf24Q9Y442 160 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 TIMM17BO60830 172 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 DAND5Q8N907 189 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 Q8NDZ9 215 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 LITAFQ99732 161 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 VPREB1P12018 145 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 HSD52Q0P140 79 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 REG3GQ6UW15 175 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-231ENST00000552222 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 TAL2Q16559 108 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 UBE2BP63146 152 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 LINC00167Q96N53 147 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 SPANXCQ9NY87 97 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 GAGE10A6NGK3 116 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 TMEM238C9JI98 176 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 BATFQ16520 125 aa8.36□□□□□ -1.07
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