RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 MAJINQ3KP22 176 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZRP5 223 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 LEPROTO15243 131 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 STPG4Q8N801 248 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 E9PLD3 99 aa5.44□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 TSTD3H0UI37 97 aa5.44□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 COX17Q14061 63 aa5.44□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 SPATA45Q537H7 98 aa5.44□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 C7orf33Q8WU49 177 aa5.44□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC01600Q96MT4 127 aa5.44□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 PRO1933Q9H354 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 HERV-K104P63124 156 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 GAGE2EQ4V326 116 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00587B1AMM8 73 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 J3QQQ9 107 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 NMUP48645 174 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 ERG28Q9UKR5 140 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PNN7 141 aa5.41□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 PFN2P35080 140 aa5.4□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 C14orf144Q96I85 54 aa5.4□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.4□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 REG3GQ6UW15 175 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 TNXBP22105 4242 aa5.39□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM168BA1KXE4 195 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 DDTP30046 118 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00158P58513 81 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 SMIM13P0DJ93 91 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTAP10-8P60410 259 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 PCP2Q8IVA1 136 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0J9YXY3 114 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF815PA8K554 130 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 M0QXV9 152 aa5.36□□□□□ -1.55
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CLSTN3-212ENST00000541770 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 C22orf24Q9Y442 160 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0U1RRA0 63 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 TIMM17BO60830 172 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 DLEU1O43261 78 aa5.34□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 VPREB1P12018 145 aa5.34□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CLSTN3-212ENST00000541770 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 LITAFQ99732 161 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 LPAP08519 4548 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2BP63146 152 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 DAND5Q8N907 189 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 Q8NDZ9 215 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00167Q96N53 147 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM238C9JI98 176 aa5.31□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 NDUFC2O95298 119 aa5.31□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.31□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.31□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 SPANXCQ9NY87 97 aa5.31□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 M0R378 163 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 CTAG1AP78358 180 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 BATFQ16520 125 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZVH6 145 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 HIGD1BQ9P298 99 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-212ENST00000541770 M0R143 59 aa5.29□□□□□ -1.56
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