RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528149.5

CCDC90B-210, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC90B, Length 987 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC90B-210ENST00000528149 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.15□□□□□ -1.26
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CCDC90B-210ENST00000528149 DLEU1O43261 78 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 S100A12P80511 92 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCDC90B-210ENST00000528149 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCDC90B-210ENST00000528149 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 NDUFC2O95298 119 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 IFITM1P13164 125 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 A6NJY4 79 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 C1orf137Q5JT78 98 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 Q6ZVH6 145 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC90B-210ENST00000528149 HIST1H4GQ99525 98 aa7.1□□□□□ -1.27
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