RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514272.2

C15orf40-208, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, human

TSL 2

Gene C15orf40, Length 457 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C15orf40-208	ENST00000514272	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	IGKC	P01834	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	PFN2	P35080	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	HERVK_113	P61574	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	LEPROT	O15243	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	KRTDAP	P60985	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	COX17	Q14061	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.91	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
C15orf40-208	ENST00000514272	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272		M0QXV9	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	S100A6	P06703	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	LINC00158	P58513	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272		A0A0U1RRA0	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272		J3QQQ9	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	S100A2	P29034	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	HERV-K104	P63124	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	UBE2B	P63146	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	C20orf202	A1L168	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272		E9PLD3	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	NMU	P48645	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	AKR1D1	P51857	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	VPREB1	P12018	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	OXT	P01178	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C15orf40-208	ENST00000514272	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272		A0A0J9YXY3	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	DAND5	Q8N907	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272		Q8NDZ9	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272		M0R378	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	BCE1	O60756	84 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	HERC1	Q15751	4861 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	ZNF861P	O60384	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	TIMM17B	O60830	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.79	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272		H0Y9J4	135 aa		4.79	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	NCR3	O14931	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	NPC2	P61916	151 aa		4.79	□□□□□ -1.64
C15orf40-208	ENST00000514272	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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