RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 COPS9Q8WXC6 57 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 ERG28Q9UKR5 140 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 TIMM17BO60830 172 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0J9YXY3 114 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 C14orf144Q96I85 54 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00158P58513 81 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZVH6 145 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 PFN2P35080 140 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 HIGD1BQ9P298 99 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM13P0DJ93 91 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 SPANXCQ9NY87 97 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 PRO1933Q9H354 126 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0U1RRA0 63 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 C16orf90A8MZG2 172 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 IFITM1P13164 125 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H4GQ99525 98 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE2BQ13066 116 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 TAL2Q16559 108 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE2EQ4V326 116 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 RYR3Q15413 4870 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 HSD52Q0P140 79 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZRP5 223 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 DAND5Q8N907 189 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 LITAFQ99732 161 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 A0A096LNI7 61 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GVY2 172 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 M0R143 59 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 DDTP30046 118 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 NPC2P61916 151 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.21□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.21□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.21□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.21□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.2□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.2□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFC2O95298 119 aa6.2□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01620Q4KN68 170 aa6.2□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.2□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 CEND1Q8N111 149 aa6.2□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 PKD1P98161 4303 aa6.2□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.19□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 DPH3Q96FX2 82 aa6.19□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.19□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 M0QXV9 152 aa6.18□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 CHTF8P0CG12 524 aa6.18□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.18□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 PKHD1P08F94 4074 aa6.17□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.17□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.17□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 CTAG1AP78358 180 aa6.17□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.17□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 A4D1N5 150 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 A6NDN8 102 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 NCR3O14931 201 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 VPREB1P12018 145 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZSA8 131 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 RAB37Q96AX2 223 aa6.16□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0B4J2C4 111 aa6.15□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.15□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 M0R378 163 aa6.15□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP10-1P60331 282 aa6.15□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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