RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TTC32Q5I0X7 151 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01545Q5VT33 79 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf223Q8N319 242 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 COX7A2LO14548 114 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 DPM2O94777 84 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGKCP01834 107 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGLC3P0DOY3 106 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf202A1L168 122 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 K7EP13 123 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 RTL8CO15255 209 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 HERVK_113P63121 156 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 PYY3Q5JQD4 70 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 RMI2Q96E14 147 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WTM6 91 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GWB2 263 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM223A0PJW6 202 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 H3BRM9 83 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 PLNP26678 52 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 SEC11AP67812 179 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf82Q6UX34 121 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf56Q8N910 161 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 APOMO95445 188 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 NMUP48645 174 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 SPAG11BQ08648 103 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0087Q14695 138 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 COX7B2Q8TF08 81 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 PRO0461Q9UI25 63 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-211ENST00000484135 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 HERVK_113P61574 105 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 CXCL6P80162 114 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 PCP2Q8IVA1 136 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf144Q96I85 54 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 RYR2Q92736 4967 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 J3QQQ9 107 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 LEPROTO15243 131 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 CKS1BP61024 79 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 SYCNQ0VAF6 134 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA45Q537H7 98 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZRU5 148 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N814 137 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 VAMP8Q9BV40 100 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 PRO1933Q9H354 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 PKD1P98161 4303 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF815PA8K554 130 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA1O15239 70 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 PFN2P35080 140 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 Q8IZM0 81 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 CARD19Q96LW7 228 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf57Q99622 126 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf48Q9UBA6 75 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 RYR3Q15413 4870 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 CHTF8P0CG12 524 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM13P0DJ93 91 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00158P58513 81 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 NPC2P61916 151 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 S100A12P80511 92 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 PRR4Q16378 134 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 DAND5Q8N907 189 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0J9YXY3 114 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM6P0DI80 62 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP10-1P60331 282 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 HAMPP81172 84 aa2.98□□□□□ -1.93
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