RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483340.1

KIF1B-208, Transcript of kinesin family member 1B, humanhuman

TSL 2

Gene KIF1B, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1B-208ENST00000483340 SFTA2Q6UW10 78 aa3.75□□□□□ -1.81
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KIF1B-208ENST00000483340 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.74□□□□□ -1.81
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KIF1B-208ENST00000483340 LINC00587B1AMM8 73 aa3.74□□□□□ -1.81
KIF1B-208ENST00000483340 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.74□□□□□ -1.81
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KIF1B-208ENST00000483340 HERV-K104P63124 156 aa3.72□□□□□ -1.81
KIF1B-208ENST00000483340 UBE2BP63146 152 aa3.72□□□□□ -1.81
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KIF1B-208ENST00000483340 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.71□□□□□ -1.82
KIF1B-208ENST00000483340 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.71□□□□□ -1.82
KIF1B-208ENST00000483340 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.71□□□□□ -1.82
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KIF1B-208ENST00000483340 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
KIF1B-208ENST00000483340 J3QQQ9 107 aa3.7□□□□□ -1.82
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KIF1B-208ENST00000483340 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.65□□□□□ -1.83
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KIF1B-208ENST00000483340 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.65□□□□□ -1.83
KIF1B-208ENST00000483340 ATOH7Q8N100 152 aa3.65□□□□□ -1.83
KIF1B-208ENST00000483340 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.65□□□□□ -1.83
KIF1B-208ENST00000483340 UBE2AP49459 152 aa3.64□□□□□ -1.83
KIF1B-208ENST00000483340 NPC2P61916 151 aa3.64□□□□□ -1.83
KIF1B-208ENST00000483340 S100A12P80511 92 aa3.64□□□□□ -1.83
KIF1B-208ENST00000483340 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.64□□□□□ -1.83
KIF1B-208ENST00000483340 Q8NDZ9 215 aa3.64□□□□□ -1.83
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