RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDZD11Q5EBL8 140 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC51BQ86UW2 128 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q8N8P6 123 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPRR1AP35321 89 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q9BRP9 147 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-171P-201ENST00000384354 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.85□□□□□ -1.95
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ERG28Q9UKR5 140 aa2.85□□□□□ -1.95
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC25A20O43772 301 aa2.84□□□□□ -1.95
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RNU6-171P-201ENST00000384354 MT1FP04733 61 aa2.83□□□□□ -1.96
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RNU6-171P-201ENST00000384354 CST9LQ9H4G1 147 aa2.83□□□□□ -1.96
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SEC11AP67812 179 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 BLOC1S1P78537 153 aa2.82□□□□□ -1.96
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEBP20929 6669 aa2.74□□□□□ -1.97
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RNU6-171P-201ENST00000384354 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.73□□□□□ -1.97
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RNU6-171P-201ENST00000384354 PEA15Q15121 130 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMIM29Q86T20 159 aa2.72□□□□□ -1.97
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