RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 S100A2P29034 98 aa4.77□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 COX17Q14061 63 aa4.77□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf25Q5T742 122 aa4.77□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.77□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.77□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.77□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PNN7 141 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM223A0PJW6 202 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 MT1HL1P0DM35 61 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 NMUP48645 174 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 HERV-K104P63124 156 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf82Q6UX34 121 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZRP5 223 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.76□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.74□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE2EQ4V326 116 aa4.74□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01545Q5VT33 79 aa4.74□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.74□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.74□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 FAM168BA1KXE4 195 aa4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 LEPROTO15243 131 aa4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 KRTDAPP60985 99 aa4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 REG3GQ6UW15 175 aa4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 ERG28Q9UKR5 140 aa4.73□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 J3QQQ9 107 aa4.72□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf79P0CE67 100 aa4.72□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.72□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01600Q96MT4 127 aa4.72□□□□□ -1.65
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf52A6NGY3 159 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 E9PLD3 99 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 M0QXV9 152 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 TRIAP1O43715 76 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf137Q5JT78 98 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 LRP2P98164 4655 aa4.71□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 PFN2P35080 140 aa4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00158P58513 81 aa4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.7□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2BP63146 152 aa4.69□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.69□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 COPS9Q8WXC6 57 aa4.69□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.69□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.69□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV7-43P04211 117 aa4.68□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.68□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 RNF213Q63HN8 5207 aa4.67□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.67□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-8P60410 259 aa4.67□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 S100A12P80511 92 aa4.67□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 DIRC1Q969H9 104 aa4.67□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 C22orf24Q9Y442 160 aa4.67□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF815PA8K554 130 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 H0Y9J4 135 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM17BO60830 172 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM13P0DJ93 91 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.66□□□□□ -1.66
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM238C9JI98 176 aa4.65□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB1D1O95968 90 aa4.65□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.65□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.65□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.65□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.64□□□□□ -1.67
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A0U1RRA0 63 aa4.64□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 M0R378 163 aa4.64□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZVH6 145 aa4.64□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.64□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.63□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFC2O95298 119 aa4.63□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 VPREB1P12018 145 aa4.63□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 ATOH7Q8N100 152 aa4.63□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 BCE1O60756 84 aa4.62□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 IFITM1P13164 125 aa4.62□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.62□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00167Q96N53 147 aa4.62□□□□□ -1.67
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