RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.48□□□□□ -1.21
PGA3-201ENST00000325558 LINC00167Q96N53 147 aa7.47□□□□□ -1.21
PGA3-201ENST00000325558 TMEM126AQ9H061 195 aa7.47□□□□□ -1.21
PGA3-201ENST00000325558 A0A087WYN8 130 aa7.47□□□□□ -1.21
PGA3-201ENST00000325558 IGLV6-57P01721 117 aa7.47□□□□□ -1.21
PGA3-201ENST00000325558 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.47□□□□□ -1.21
PGA3-201ENST00000325558 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.46□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.45□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZRU5 148 aa7.45□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.45□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 B9D2Q9BPU9 175 aa7.45□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GX51 115 aa7.44□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.44□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.44□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.44□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.44□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.44□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 SIGMAR1Q99720 223 aa7.44□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.42□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 SLPIP03973 132 aa7.42□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 VPREB1P12018 145 aa7.42□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 Q9HAA7 133 aa7.42□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 APLNQ9ULZ1 77 aa7.41□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.41□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 NCR3O14931 201 aa7.41□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 LECT2O14960 151 aa7.41□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.41□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 PCP4P48539 62 aa7.41□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 CASC10Q5T4H9 136 aa7.41□□□□□ -1.22
PGA3-201ENST00000325558 XGP55808 180 aa7.4□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 SYCNQ0VAF6 134 aa7.4□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZRP5 223 aa7.4□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 Q8N814 137 aa7.4□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.4□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 COL7A1Q02388 2944 aa7.39□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 C6orf99Q4VX62 202 aa7.39□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 LINC00575Q6W349 94 aa7.38□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.38□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 SCGB1A1P11684 91 aa7.38□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.38□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.37□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 USP17L23D6RBM5 183 aa7.37□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.37□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.37□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 M0R378 163 aa7.36□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 DNAL4O96015 105 aa7.36□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 MT-ATP8P03928 68 aa7.36□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 RMI2Q96E14 147 aa7.36□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.35□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 ACYP1P07311 99 aa7.34□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.34□□□□□ -1.23
PGA3-201ENST00000325558 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.33□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.33□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.33□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.33□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.33□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 GAGE2EQ4V326 116 aa7.32□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.32□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.32□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 hADV29S1A0JD25 119 aa7.31□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.31□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.31□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.31□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.3□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 DIRC1Q969H9 104 aa7.3□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.3□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 FBN3Q75N90 2809 aa7.3□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.3□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 Q6Q795 121 aa7.29□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 C7orf33Q8WU49 177 aa7.29□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 COX7BP24311 80 aa7.28□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.28□□□□□ -1.24
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 SPRR1AP35321 89 aa7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 LYSTQ99698 3801 aa7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 NUPR2A6NF83 97 aa7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 H3BQ85 93 aa7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 SNCGO76070 127 aa7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.26□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.25□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.25□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.25□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 FAM168BA1KXE4 195 aa7.25□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 CCKP06307 115 aa7.25□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZQY7 126 aa7.25□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.24□□□□□ -1.25
PGA3-201ENST00000325558 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms