RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 APCSP02743 223 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBX1P62877 108 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 ENHOQ6UWT2 76 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 BORCS7Q96B45 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 NIT2Q9NQR4 276 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A1B0GVG6 124 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 A8MWL6 223 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM250H0YL14 139 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 LINC00614P0C842 121 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 MIAQ16674 131 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 YPEL4Q96NS1 127 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF727A8MUV8 499 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 IQCJQ1A5X6 159 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 C1orf195Q5TG92 126 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 C15orf56Q8N910 161 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAT1Q14517 4588 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 FA2HQ7L5A8 372 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRP2P98164 4655 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A1B0GUT8 65 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIGD1CA8MV81 97 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 BPY2O14599 106 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCO1O75880 301 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 TEX261Q6UWH6 196 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 LINC01551Q86U37 167 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 DPH3Q96FX2 82 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 CNFNQ9BYD5 112 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 G0S2P27469 103 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 MP68P56378 58 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SYCNQ0VAF6 134 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADIRFQ15847 76 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCXQ7RTU7 201 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 ORMDL3Q8N138 153 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 TSKUQ8WUA8 353 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 ST20Q9HBF5 79 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR34Q9NV39 138 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4DIP-241ENST00000616206 I3L3M4 83 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 PEA15Q15121 130 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 BTF3L4Q96K17 158 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 OSTCQ9NRP0 149 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 C9JQL5 133 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 NCR2O95944 276 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 FGF6P10767 208 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 S100A2P29034 98 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 FCER1GP30273 86 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q6ZSA8 131 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 AMN1Q8IY45 258 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF861PO60384 105 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 GAS8-AS1O95177 125 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 LUZP6Q538Z0 58 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 NUP35Q8NFH5 326 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 NAT8Q9UHE5 227 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 V9GYV3 84 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM223A0PJW6 202 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPP1R17O96001 155 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 XCL1P47992 114 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 CKS2P33552 79 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 DSCR10P59022 87 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAB14P61106 215 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 SS18Q15532 418 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A096LNJ9 63 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCL25O15444 150 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4DIP-241ENST00000616206 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
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