RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
CTDSP1-215ENST00000498160 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
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CTDSP1-215ENST00000498160 HERV-K104P63124 156 aa11.41□□□□□ -0.58
CTDSP1-215ENST00000498160 Q6ZRU5 148 aa11.41□□□□□ -0.58
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CTDSP1-215ENST00000498160 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.4□□□□□ -0.58
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CTDSP1-215ENST00000498160 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTDSP1-215ENST00000498160 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTDSP1-215ENST00000498160 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTDSP1-215ENST00000498160 ATOH7Q8N100 152 aa11.37□□□□□ -0.59
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CTDSP1-215ENST00000498160 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.37□□□□□ -0.59
CTDSP1-215ENST00000498160 C10orf25Q5T742 122 aa11.35□□□□□ -0.59
CTDSP1-215ENST00000498160 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.34□□□□□ -0.59
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CTDSP1-215ENST00000498160 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.32□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.32□□□□□ -0.6
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CTDSP1-215ENST00000498160 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.32□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 ERG28Q9UKR5 140 aa11.32□□□□□ -0.6
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CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF815PA8K554 130 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 S100A12P80511 92 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 PKD1P98161 4303 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 PTTG1IPP53801 180 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP1-215ENST00000498160 TIMM17BO60830 172 aa11.27□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 SMIM6P0DI80 62 aa11.27□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.619e-7■□□□□ 9.5
CTDSP1-215ENST00000498160 MAJINQ3KP22 176 aa11.27□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 SPATA45Q537H7 98 aa11.27□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
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CTDSP1-215ENST00000498160 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.24□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM238C9JI98 176 aa11.24□□□□□ -0.61
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CTDSP1-215ENST00000498160 PCP2Q8IVA1 136 aa11.22□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 DPH3Q96FX2 82 aa11.22□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.21□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.21□□□□□ -0.61
CTDSP1-215ENST00000498160 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.2□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.19□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.19□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.19□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.19□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.19□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 CDK2AP2O75956 126 aa11.18□□□□□ -0.62
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CTDSP1-215ENST00000498160 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.18□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.17□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A0U1RRA0 63 aa11.17□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 CHTF8P0CG12 524 aa11.17□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.17□□□□□ -0.62
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CTDSP1-215ENST00000498160 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.17□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 IFITM1P13164 125 aa11.16□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.16□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 PKHD1P08F94 4074 aa11.16□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A087WYN8 130 aa11.15□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 LITAFQ99732 161 aa11.15□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.15□□□□□ -0.62
CTDSP1-215ENST00000498160 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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