RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 IGIPA6NJ69 53 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 DLEU1O43261 78 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 XCL1P47992 114 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 PMVKQ15126 192 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 SS18Q15532 418 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 MAJINQ3KP22 176 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-210ENST00000462125 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WYN8 130 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 J3QL48 77 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 COX6A2Q02221 97 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 CHTF8P0CG12 524 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 HERVK_113P61574 105 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 DPH3Q96FX2 82 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 OXTP01178 125 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 CTAG1AP78358 180 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 STPG4Q8N801 248 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 FAM104AQ969W3 186 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 VCX2Q9H322 139 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 CST9LQ9H4G1 147 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 NMUP48645 174 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf86A6NJI1 115 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZUT4 128 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 HIGD1BQ9P298 99 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-210ENST00000462125 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.34□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 E9PLD3 99 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 COX7A2LO14548 114 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 SYCNQ0VAF6 134 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 A0A096LNI7 61 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 MALP21145 153 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 CARD19Q96LW7 228 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 AMELXQ99217 191 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 SEC11AP67812 179 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 HSD52Q0P140 79 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZRU5 148 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 C5orf38Q86SI9 138 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf48Q96LS8 159 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 APOMO95445 188 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 BATFQ16520 125 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 TAL2Q16559 108 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 C7orf33Q8WU49 177 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 PCP2Q8IVA1 136 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-210ENST00000462125 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 F8WDY8 70 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 PTTG1IPP53801 180 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 RNF151Q2KHN1 245 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM223A0PJW6 202 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 H3BRM9 83 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 LEPROTO15243 131 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0J9YXV3 536 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 A6NDN8 102 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 SPAG11BQ08648 103 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF815PA8K554 130 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.1 ms