RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	MAJIN	Q3KP22	176 aa		9.29	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		9.29	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		9.29	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	CHTF8	P0CG12	524 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00310	P59036	64 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	CKS1B	P61024	79 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BK	O60814	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	LEPROTL1	O95214	131 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BO	P23527	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BB	P33778	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BD	P58876	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BC	P62807	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf25	Q5T742	122 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241		F8VRH5	84 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	STPG4	Q8N801	248 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	COX7B2	Q8TF08	81 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE2B	Q13066	116 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf82	Q6UX34	121 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	SFTA2	Q6UW10	78 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf86	A6NJI1	115 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	SPINK8	P0C7L1	97 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM6	P0DI80	62 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	S100A2	P29034	98 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf33	Q8WU49	177 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	NUPR1	O60356	82 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZRP5	223 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PTPA-222	ENST00000445241	AKR1D1	P51857	326 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	ODF1	Q14990	250 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	PLN	P26678	52 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM223	A0PJW6	202 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PNN7	141 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	FABP4	P15090	132 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	S100A12	P80511	92 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE2E	Q4V326	116 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	COX17	Q14061	63 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	9.15	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	DPM2	O94777	84 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241	FAT1	Q14517	4588 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPA-222	ENST00000445241		H0Y8G0	127 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	C12orf57	Q99622	126 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	IGKC	P01834	107 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	HERVK_113	P61574	105 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	HERV-K104	P63124	156 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	PET117	Q6UWS5	81 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	ERG28	Q9UKR5	140 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	FAM168B	A1KXE4	195 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00587	B1AMM8	73 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241		M0QXV9	152 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	LEPROT	O15243	131 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01545	Q5VT33	79 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPA-222	ENST00000445241	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPA-222	ENST00000445241	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPA-222	ENST00000445241	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPA-222	ENST00000445241	NMU	P48645	174 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPA-222	ENST00000445241	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PTPA-222	ENST00000445241	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96

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