RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00310P59036 64 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BCP62807 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.77□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.77□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.76□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.76□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPH3Q96FX2 82 aa9.74□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A096LNI7 61 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F8VRH5 84 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUPR1O60356 82 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHTF8P0CG12 524 aa9.73□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTTG1IPP53801 180 aa9.73□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.73□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WYN8 130 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf86A6NJI1 115 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.71□□□□□ -0.86
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q5VSD8 79 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf82Q6UX34 121 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAT1Q14517 4588 aa9.7□□□□□ -0.86
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.69□□□□□ -0.86
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.69□□□□□ -0.86
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM223A0PJW6 202 aa9.65□□□□□ -0.86
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C7orf33Q8WU49 177 aa9.65□□□□□ -0.86
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAGE2EQ4V326 116 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKCP01834 107 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PET117Q6UWS5 81 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PNN7 141 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HERVK_113P61574 105 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX17Q14061 63 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01545Q5VT33 79 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HERV-K104P63124 156 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.57□□□□□ -0.88
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00587B1AMM8 73 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKR1D1P51857 326 aa9.56□□□□□ -0.88
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LEPROTO15243 131 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A6P06703 90 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C3orf79P0CE67 100 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM168BA1KXE4 195 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PFN2P35080 140 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NMUP48645 174 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 J3QQQ9 107 aa9.53□□□□□ -0.88
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