RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CXCL5P42830 114 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 Q5VSD8 79 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1G1O75348 118 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 PTTG1IPP53801 180 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 GAGE2BQ13066 116 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf82Q6UX34 121 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BKO60814 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BJP06899 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BOP23527 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BBP33778 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BDP58876 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BCP62807 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf25Q5T742 122 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 COX7B2Q8TF08 81 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINK8P0C7L1 97 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00310P59036 64 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 STPG4Q8N801 248 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 F8VRH5 84 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf86A6NJI1 115 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 NUPR1O60356 82 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 FABP4P15090 132 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 C7orf33Q8WU49 177 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 H0Y8G0 127 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 SFTA2Q6UW10 78 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZRP5 223 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 FAT1Q14517 4588 aa9.71□□□□□ -0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 PLNP26678 52 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 GAGE2EQ4V326 116 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 ODF1Q14990 250 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM223A0PJW6 202 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PNN7 141 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 DPM2O94777 84 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 HERVK_113P61574 105 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-202ENST00000379615 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKCP01834 107 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 COX17Q14061 63 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 PET117Q6UWS5 81 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 ERG28Q9UKR5 140 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 HERC1Q15751 4861 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM168BA1KXE4 195 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00587B1AMM8 73 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 PFN2P35080 140 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 HERV-K104P63124 156 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 LEPROTO15243 131 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 M0QXV9 152 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A6P06703 90 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01545Q5VT33 79 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-202ENST00000379615 C20orf202A1L168 122 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00158P58513 81 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTDAPP60985 99 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf79P0CE67 100 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A2P29034 98 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 AKR1D1P51857 326 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2BP63146 152 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 J3QQQ9 107 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 NMUP48645 174 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-202ENST00000379615 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms