RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.74□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 A0A0J9YXV3 536 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 D6R8Y8 96 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 PPBPP02775 128 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 MAJINQ3KP22 176 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 ORMDL3Q8N138 153 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 DPH3Q96FX2 82 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 PRSS47A8MTI9 375 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 HSBP1O75506 76 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 GAS8-AS1O95177 125 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 LINC00614P0C842 121 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 SMIM17P0DL12 118 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 PMCHP20382 165 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 FOXI1Q12951 378 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 PRELID3AQ96N28 172 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-206ENST00000474188 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 NPYP01303 97 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 STPG4Q8N801 248 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 A0A096LNJ9 63 aa6.7□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 SMKR1H3BMG3 65 aa6.7□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 C3orf79P0CE67 100 aa6.7□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 CKS2P33552 79 aa6.7□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 NRACQ8N912 160 aa6.7□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.69□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.69□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 A0A1W2PNN7 141 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 H7C1H1 209 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 TNFRSF6BO95407 300 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 NCR2O95944 276 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 SCGB1D1O95968 90 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 C7orf33Q8WU49 177 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 MRAP2Q96G30 205 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 LINC00587B1AMM8 73 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 KRTDAPP60985 99 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 COTL1Q14019 142 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 PMCHL1Q16048 86 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 FA2HQ7L5A8 372 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.67□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 LEPROTL1O95214 131 aa6.66□□□□□ -1.34
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NISCH-206ENST00000474188 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.66□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 Q8N8P6 123 aa6.66□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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NISCH-206ENST00000474188 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.65□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 UBE2L6O14933 153 aa6.65□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 XCL1P47992 114 aa6.65□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 CFAP161Q6P656 301 aa6.65□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 C20orf78Q9BR46 151 aa6.65□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.65□□□□□ -1.34
NISCH-206ENST00000474188 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.64□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 CCL25O15444 150 aa6.64□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 PET117Q6UWS5 81 aa6.64□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.64□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 TSTD3H0UI37 97 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 TSHBP01222 138 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 HBDP02042 147 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 FCER1GP30273 86 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 LINC01545Q5VT33 79 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 PRO1933Q9H354 126 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 MUC17Q685J3 4493 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 K7EMI3 77 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 PPP1R17O96001 155 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 DDTP30046 118 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 PTTG1IPP53801 180 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 CARD19Q96LW7 228 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 Q6ZRP5 223 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 VAMP8Q9BV40 100 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 C20orf202A1L168 122 aa6.6□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 H7C423 109 aa6.6□□□□□ -1.35
NISCH-206ENST00000474188 SYCNQ0VAF6 134 aa6.6□□□□□ -1.35
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