RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618511.4

RDM1-222, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 518 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-222	ENST00000618511	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	ISOC2	Q96AB3	205 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	LINC00862	A6NCI5	91 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511		I3L3M4	83 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	PHOX2A	O14813	284 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	LECT2	O14960	151 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	PPP1R2P9	O14990	202 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	GAGE6	Q13070	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	BORCS7	Q96B45	105 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	C20orf78	Q9BR46	151 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	NAT8	Q9UHE5	227 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RDM1-222	ENST00000618511	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511		A0A1B0GXF2	115 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511		B5MCH6	92 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	UBE2L6	O14933	153 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	TSHB	P01222	138 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	APCS	P02743	223 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	S100A8	P05109	93 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	FGF6	P10767	208 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	RAB4A	P20338	218 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	RIG	Q13278	110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	PEA15	Q15121	130 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	NRAC	Q8N912	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	NUP35	Q8NFH5	326 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511		A0A1B0GVG6	124 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511		C9JQL5	133 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	VCY	O14598	125 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	OXT	P01178	125 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	PPBP	P02775	128 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	FOXI1	Q12951	378 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	ST20	Q9HBF5	79 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	PRSS47	A8MTI9	375 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	SLPI	P03973	132 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	NPS	P0C0P6	89 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	SST	P61278	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511		F8W036	122 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511		F8WDY8	70 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	GAS8-AS1	O95177	125 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	PMCH	P20382	165 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	CEBPG	P53567	150 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	HBB	P68871	147 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	BTF3L4	Q96K17	158 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	PANO1	I0J062	215 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511		K7EMI3	77 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	HAMP	P81172	84 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	ADIRF	Q15847	76 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RDM1-222	ENST00000618511	LINC01620	Q4KN68	170 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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