RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R2P9O14990 202 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 CCL25O15444 150 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 ESDP10768 282 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 RAB4AP20338 218 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 XCL1P47992 114 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 COX6A2Q02221 97 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM18Q96B42 140 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 TCAPO15273 167 aa10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 TSHBP01222 138 aa10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1B0GW15 77 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 FOXI1Q12951 378 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 MAJINQ3KP22 176 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 AMN1Q8IY45 258 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 ISOC2Q96AB3 205 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.56□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.55□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 CHTF8P0CG12 524 aa10.55□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 NUP35Q8NFH5 326 aa10.55□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.55□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00862A6NCI5 91 aa10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 S100A8P05109 93 aa10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 MALP21145 153 aa10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 PEA15Q15121 130 aa10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 NAT8Q9UHE5 227 aa10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 V9GYV3 84 aa10.54□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 ADIRFQ15847 76 aa10.53□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 STPG4Q8N801 248 aa10.53□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.53□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 CARD19Q96LW7 228 aa10.53□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.53□□□□□ -0.72
SPNS1-211ENST00000568829 PHOX2AO14813 284 aa10.51□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 C20orf78Q9BR46 151 aa10.51□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.51□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 F8W036 122 aa10.5□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 COX7A2LO14548 114 aa10.5□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 GAS8-AS1O95177 125 aa10.5□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 APOMO95445 188 aa10.5□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 SYCNQ0VAF6 134 aa10.5□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 FAM104BQ5XKR9 115 aa10.5□□□□□ -0.73
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SPNS1-211ENST00000568829 CAMPP49913 170 aa10.49□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.48□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 SMKR1H3BMG3 65 aa10.48□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 NRACQ8N912 160 aa10.48□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.48□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.48□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.47□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 A0A096LNI7 61 aa10.47□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.46□□□□□ -0.73
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SPNS1-211ENST00000568829 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa10.46□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 PPBPP02775 128 aa10.46□□□□□ -0.73
SPNS1-211ENST00000568829 HBBP68871 147 aa10.45□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 C2orf48Q96LS8 159 aa10.45□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.45□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.44□□□□□ -0.74
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SPNS1-211ENST00000568829 TNFRSF6BO95407 300 aa10.43□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 REG3GQ6UW15 175 aa10.43□□□□□ -0.74
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SPNS1-211ENST00000568829 PTTG1IPP53801 180 aa10.42□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 GAGE2BQ13066 116 aa10.42□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.42□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa10.42□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.42□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 D6R8Y8 96 aa10.41□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.41□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 Q6ZUT4 128 aa10.4□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 C5orf38Q86SI9 138 aa10.4□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 ORMDL3Q8N138 153 aa10.4□□□□□ -0.74
SPNS1-211ENST00000568829 C9JQL5 133 aa10.39□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 SPAG11BQ08648 103 aa10.39□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 RNF151Q2KHN1 245 aa10.39□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 IMMP2LQ96T52 175 aa10.39□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.39□□□□□ -0.75
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