RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
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ITGA3-215ENST00000515147 TSHBP01222 138 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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ITGA3-215ENST00000515147 SS18Q15532 418 aa11.16□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.16□□□□□ -0.62
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ITGA3-215ENST00000515147 C2orf48Q96LS8 159 aa11.04□□□□□ -0.64
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ITGA3-215ENST00000515147 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.01□□□□□ -0.65
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ITGA3-215ENST00000515147 C1orf137Q5JT78 98 aa11□□□□□ -0.65
ITGA3-215ENST00000515147 Q6ZUT4 128 aa11□□□□□ -0.65
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ITGA3-215ENST00000515147 RNF151Q2KHN1 245 aa10.99□□□□□ -0.65
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ITGA3-215ENST00000515147 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-215ENST00000515147 V9GYV3 84 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF727A8MUV8 499 aa10.98□□□□□ -0.65
ITGA3-215ENST00000515147 PPP1R2P9O14990 202 aa10.97□□□□□ -0.65
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM18Q96B42 140 aa10.97□□□□□ -0.65
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ITGA3-215ENST00000515147 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.95□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 FAM104AQ969W3 186 aa10.95□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa10.94□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 IGLV7-43P04211 117 aa10.94□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 S100A1P23297 94 aa10.94□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.94□□□□□ -0.66
ITGA3-215ENST00000515147 DIRC1Q969H9 104 aa10.94□□□□□ -0.66
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