RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 BTF3L4Q96K17 158 aa6.88□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 BIN3Q9NQY0 253 aa6.88□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.88□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 TEX46H3BTG2 121 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 H7C423 109 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 CEBPGP53567 150 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 ST20Q9HBF5 79 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.87□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 SS18Q15532 418 aa6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 C5orf38Q86SI9 138 aa6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 MRAP2Q96G30 205 aa6.86□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.85□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 MT-ND6P03923 174 aa6.85□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 AMN1Q8IY45 258 aa6.85□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.85□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 COX7A2LO14548 114 aa6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 MALP21145 153 aa6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 C1orf137Q5JT78 98 aa6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 TEX261Q6UWH6 196 aa6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 NUP35Q8NFH5 326 aa6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.84□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 FAM168BA1KXE4 195 aa6.83□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.83□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 A8MWL6 223 aa6.83□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 RAB4AP20338 218 aa6.83□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZUT4 128 aa6.83□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.82□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 HIGD1CA8MV81 97 aa6.82□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 APOMO95445 188 aa6.82□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GUT8 65 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 FCER1GP30273 86 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 SPAG11BQ08648 103 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 C10orf25Q5T742 122 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 SLC51BQ86UW2 128 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 NRACQ8N912 160 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.81□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 ISOC2Q96AB3 205 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 BORCS7Q96B45 105 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 VCYO14598 125 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 TSKUQ8WUA8 353 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 FAM104AQ969W3 186 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 A0A087WZ39 114 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 TMEM250H0YL14 139 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 IGLV7-43P04211 117 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 CT83Q5H943 113 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 LINC01551Q86U37 167 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 C2orf48Q96LS8 159 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-209ENST00000473257 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 GAGE2EQ4V326 116 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 V9GYV3 84 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 H0Y9J4 135 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 DIRC1Q969H9 104 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 OSTCQ9NRP0 149 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 ZNF727A8MUV8 499 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 RIGQ13278 110 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 PRR4Q16378 134 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DL4Q99706 377 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 TCAPO15273 167 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 BLOC1S1P78537 153 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 RNF151Q2KHN1 245 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.73□□□□□ -1.33
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