RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 APCSP02743 223 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 OCC1Q8TAD7 63 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 NUDT11Q96G61 164 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 BIN3Q9NQY0 253 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 FGF6P10767 208 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 CNFNQ9BYD5 112 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 K7EN84 100 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 XCL1P47992 114 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 FOXI1Q12951 378 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 SVBPQ8N300 66 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 LINC01600Q96MT4 127 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 NCR2O95944 276 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 LINC01551Q86U37 167 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 CCL25O15444 150 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 SCO1O75880 301 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 SNAPINO95295 136 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 BTF3L4Q96K17 158 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 CARD19Q96LW7 228 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 H7C423 109 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 ISOC2Q96AB3 205 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0J9YXV3 536 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 PMCHP20382 165 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM101Q96IK0 257 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 FAM231BA6NCW3 169 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 I3L3M4 83 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 GAS8-AS1O95177 125 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 REG3GQ6UW15 175 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 MRAP2Q96G30 205 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 TSHBP01222 138 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 MT-ND4LP03901 98 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 RHEBQ15382 184 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 ESDP10768 282 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 CAMPP49913 170 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 SYCNQ0VAF6 134 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 SS18Q15532 418 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZRP5 223 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 ST20Q9HBF5 79 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 LPAP08519 4548 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 PTTG1IPP53801 180 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP10-8P60410 259 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 GAGE2BQ13066 116 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 BORCS7Q96B45 105 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 OSTCQ9NRP0 149 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 V9GYV3 84 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 A8MWL6 223 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 PPP1R2P9O14990 202 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.21□□□□□ -1.26
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GARNL3-210ENST00000453030 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1W2PNN7 141 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 SMKR1H3BMG3 65 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 CT83Q5H943 113 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 AMN1Q8IY45 258 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GUT8 65 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 HIGD1CA8MV81 97 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 COX7A2LO14548 114 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 FCER1GP30273 86 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.18□□□□□ -1.26
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