RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 APCSP02743 223 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 BCL2P10415 239 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 A0A096LNI7 61 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 NCR2O95944 276 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 FGF6P10767 208 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 FOXI1Q12951 378 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 CNFNQ9BYD5 112 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLRN3-201ENST00000368671 H7C423 109 aa6.48□□□□□ -1.37
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CLRN3-201ENST00000368671 PMCHP20382 165 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 XCL1P47992 114 aa6.48□□□□□ -1.37
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CLRN3-201ENST00000368671 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.48□□□□□ -1.37
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CLRN3-201ENST00000368671 BTF3L4Q96K17 158 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN3-201ENST00000368671 CCL25O15444 150 aa6.47□□□□□ -1.37
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CLRN3-201ENST00000368671 LINC01600Q96MT4 127 aa6.47□□□□□ -1.37
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CLRN3-201ENST00000368671 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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CLRN3-201ENST00000368671 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.45□□□□□ -1.38
CLRN3-201ENST00000368671 FAM231BA6NCW3 169 aa6.45□□□□□ -1.38
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CLRN3-201ENST00000368671 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.44□□□□□ -1.38
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CLRN3-201ENST00000368671 REG3GQ6UW15 175 aa6.43□□□□□ -1.38
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CLRN3-201ENST00000368671 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
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CLRN3-201ENST00000368671 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN3-201ENST00000368671 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1B0GUT8 65 aa6.39□□□□□ -1.39
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CLRN3-201ENST00000368671 SMKR1H3BMG3 65 aa6.39□□□□□ -1.39
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CLRN3-201ENST00000368671 COX7A2LO14548 114 aa6.38□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 BLOC1S1P78537 153 aa6.38□□□□□ -1.39
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CLRN3-201ENST00000368671 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.37□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.37□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 VCYO14598 125 aa6.37□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 C5orf38Q86SI9 138 aa6.37□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.37□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.37□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 APOMO95445 188 aa6.36□□□□□ -1.39
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