RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 Q6ZRP5 223 aa6.46□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GW15 77 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 S100A8P05109 93 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 GAGE6Q13070 117 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.45□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 S100A6P06703 90 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 ZNF56Q15929 161 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 IQCJQ1A5X6 159 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.44□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GUV1 79 aa6.43□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIGD1CA8MV81 97 aa6.43□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 LINC01559Q495D7 138 aa6.43□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.43□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 BORCS7Q96B45 105 aa6.43□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 SH2D1AO60880 128 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 TRGC2P03986 189 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 C15orf56Q8N910 161 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 NUP35Q8NFH5 326 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.42□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 A0A096LNI7 61 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GXF2 115 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BKO60814 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BJP06899 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BOP23527 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BBP33778 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 CRIP1P50238 77 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BDP58876 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BCP62807 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HBBP68871 147 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 GATD1Q8NB37 220 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.41□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GUT8 65 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 C5orf52A6NGY3 159 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 F5H697 171 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 TRGC1P0CF51 173 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 CTRLP40313 264 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 RIGQ13278 110 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 CNFNQ9BYD5 112 aa6.4□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.39□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 F2Z2F3 143 aa6.39□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 CACNG7P62955 275 aa6.39□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.39□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.39□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 IGLC6P0CF74 106 aa6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 TMEM243Q9BU79 118 aa6.38□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 OR5AL1P0C617 328 aa6.37□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 SMIM17P0DL12 118 aa6.37□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.37□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.37□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 UBE2L6O14933 153 aa6.36□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 SNAI2O43623 268 aa6.36□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 APCSP02743 223 aa6.36□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 PRR4Q16378 134 aa6.36□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.36□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 NDUFA6P56556 154 aa6.35□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.35□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 ESDP10768 282 aa6.34□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 S100A2P29034 98 aa6.34□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 CAMPP49913 170 aa6.34□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.34□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.34□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 DIRC1Q969H9 104 aa6.34□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 AP1S3Q96PC3 154 aa6.34□□□□□ -1.39
USP41-201ENST00000292729 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.33□□□□□ -1.4
USP41-201ENST00000292729 M0QY20 66 aa6.33□□□□□ -1.4
USP41-201ENST00000292729 PPBPP02775 128 aa6.33□□□□□ -1.4
USP41-201ENST00000292729 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.33□□□□□ -1.4
USP41-201ENST00000292729 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP41-201ENST00000292729 CARD19Q96LW7 228 aa6.33□□□□□ -1.4
USP41-201ENST00000292729 TPPP3Q9BW30 176 aa6.33□□□□□ -1.4
USP41-201ENST00000292729 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms