RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567092.1

CFAP20-206, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, human

TSL 2

Gene CFAP20, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP20-206	ENST00000567092	TM4SF4	P48230	202 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	BCAM	P50895	628 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	PRKG1	Q13976	671 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	CRK	P46108	304 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	RGS19	P49795	217 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	RASA3	Q14644	834 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	NUDT7	P0C024	238 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	CIAO1	O76071	339 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	NF2	P35240	595 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	CAP1	Q01518	475 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	CACNB3	P54284	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	FOXK1	P85037	733 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	LPIN2	Q92539	896 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	SIL1	Q9H173	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PTPRF	P10586	1907 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	MYO1B	O43795	1136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	ADORA1	P30542	326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PBX2	P40425	430 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PHKA1	P46020	1223 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PDE1A	P54750	535 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PTPN18	Q99952	460 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	GPR25	O00155	361 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	MX1	P20591	662 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	PRDX5	P30044	214 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CFAP20-206	ENST00000567092	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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