RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 MEIOBQ8N635 442 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SVIPQ8NHG7 77 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 EXOC2Q96KP1 924 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 A0A1B0GTH6 734 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NFKBIEO00221 500 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 GRIN3BO60391 1043 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 RAPGEF3O95398 923 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 RARAP10276 462 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TIMP2P16035 220 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NME2P22392 152 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 L1CAMP32004 1257 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 POU4F2Q12837 409 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 HYAL2Q12891 473 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 MTMR1Q13613 665 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CCINQ13939 588 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 LRRC14Q15048 493 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NXNQ6DKJ4 435 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CEP120Q8N960 986 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 HHIPQ96QV1 700 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ZFATQ9P243 1243 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ARAFP10398 606 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CDC27P30260 824 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CCNFP41002 786 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NXPE3Q969Y0 559 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 GSX2Q9BZM3 304 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 FAM83GA6ND36 823 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SPINT1O43278 529 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PSAPP07602 524 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SDSP20132 328 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 MLC1Q15049 377 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 KSR2Q6VAB6 950 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PASD1Q8IV76 773 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 HOOK2Q96ED9 719 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 MTMR8Q96EF0 704 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GPR39O43194 453 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PDE6BP35913 854 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 KCNC4Q03721 635 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ITKQ08881 620 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 MAP7Q14244 749 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SULF2Q8IWU5 870 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 STK35Q8TDR2 534 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 FBXO41Q8TF61 875 aa6.27□□□□□ -1.41
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STRADB-210ENST00000498648 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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