RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 EN2P19622 333 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 BTDP43251 543 aa27.69■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K10Q02779 954 aa27.69■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 PI16Q6UXB8 463 aa27.69■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 SLF2Q8IX21 1173 aa27.69■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 CPA4Q9UI42 421 aa27.69■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 DOCK2Q92608 1830 aa27.69■■■□□ 2.02
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POLR2F-211ENST00000488684 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.68■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.68■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 CTGFP29279 349 aa27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 RHBDL3P58872 404 aa27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 KIF22Q14807 665 aa27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.67■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 CXCL11O14625 94 aa27.66■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
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POLR2F-211ENST00000488684 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.66■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 SPATA5Q8NB90 893 aa27.66■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRAP18433 802 aa27.65■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 GORABQ5T7V8 394 aa27.65■■■□□ 2.02
POLR2F-211ENST00000488684 NBPF11Q86T75 865 aa27.65■■■□□ 2.02
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POLR2F-211ENST00000488684 MCAMP43121 646 aa27.63■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 SH3TC2Q8TF17 1288 aa27.63■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM47Q96LD4 638 aa27.63■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.63■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 MYCP01106 439 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 PSMC4P43686 418 aa27.62■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 POLA2Q14181 598 aa27.62■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 PICK1Q9NRD5 415 aa27.62■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 CYP2C8P10632 490 aa27.61■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
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POLR2F-211ENST00000488684 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 LDHCP07864 332 aa27.6■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 PRMT2P55345 433 aa27.6■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 RAI14Q9P0K7 980 aa27.6■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 BCRP11274 1271 aa27.59■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 GSTO1P78417 241 aa27.59■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 ATP8B2P98198 1209 aa27.59■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 SSH3Q8TE77 659 aa27.59■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 SRRDQ9UH36 339 aa27.59■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.59■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 TBC1D12O60347 775 aa27.58■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.58■■■□□ 2.01
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POLR2F-211ENST00000488684 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.58■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 MIER1Q8N108 512 aa27.58■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
POLR2F-211ENST00000488684 DOCK1Q14185 1865 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRFP10586 1907 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 FAM196BA6NMK8 535 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 TNNI3KQ59H18 835 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 GPR108Q9NPR9 543 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 SNRKQ9NRH2 765 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.57■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.56■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.56■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 RLBP1P12271 317 aa27.55■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.55■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM75PA6NK02 468 aa27.54■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 CEP290O15078 2479 aa27.54■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 HOXD10P28358 340 aa27.54■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 MTFR1Q15390 333 aa27.54■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.53■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 TEX11Q8IYF3 940 aa27.53■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.53■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 MYPNQ86TC9 1320 aa27.52■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 RAET1EQ8TD07 263 aa27.52■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 MGAMO43451 1857 aa27.52■■■□□ 2
POLR2F-211ENST00000488684 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
POLR2F-211ENST00000488684 GRK4P32298 578 aa27.51■■□□□ 1.99
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