RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	CAMP	P49913	170 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	MGST2	Q99735	147 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	DERL1	Q9BUN8	251 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GUV1	79 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	HMSD	A8MTL9	139 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	FGF7	P21781	194 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF345	Q14585	488 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZRG5	221 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	PFDN5	Q99471	154 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	SMLR1	H3BR10	107 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	ARPC5	O15511	151 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	SFRP2	Q96HF1	295 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	SERF2	P84101	59 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	TREM1	Q9NP99	234 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	XCL1	P47992	114 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	TMED6	Q8WW62	240 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617	HYLS1	Q96M11	299 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BVH4	76 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	BCL2L11	O43521	198 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	MB	P02144	154 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP6V0C	P27449	155 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	PSG8	Q9UQ74	426 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	TMUB2	Q71RG4	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	SGK494	Q96LW2	274 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	PFDN1	O60925	122 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	TAS2R45	P59539	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617		Q8N377	158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	STOML3	Q8TAV4	291 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PPV4	95 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	NUPR1	O60356	82 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	KHDC3L	Q587J8	217 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	ISOC2	Q96AB3	205 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	C9orf92	A6NGG3	77 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	UMAD1	C9J7I0	102 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	STAG3L2	P0CL84	134 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	STAG3L3	P0CL85	134 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	CSN1S1	P47710	185 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC51B	Q86UW2	128 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCD4-222	ENST00000555617	IL36B	Q9NZH7	164 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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